沈陽農業大學的辦學歷史可追溯到我國農業教育的始興時期—1906年清政府設立的省立奉天農業學堂，以后經歷了奉天農業大學、東北大學農學院和沈陽農學院幾個歷史時期，1952年全國高等院校調整，與復旦大學農學院合并組建成了新的沈陽農學院。1979年10月經國務院批準為全國重點高等院校
1981年被批準為首批具有博士、碩士學位授予權單位；1985年10月，更名為沈陽農業大學，鄧小平同志親自為學校題寫了校名。2000年，學校由農業部所屬劃轉為以遼寧省管理為主、遼寧省與中央共建的全國重點大學。
學校形成了比較完整的農業教育科研體系。現有6個博士后科研流動站，75個博士學位授予權專業，115個碩士學位授予權專業，57個本科專業；學校有3個國家重點學科，3個農業部重點學科，7個遼寧省高等學校一流特色學科，24個遼寧省重點學科。根據科睿唯安發布的最新ESI數據顯示，我校農業科學持續進入全球ESI前1%學科。
學校設有16個學院、4個教學部（中心、所）；有包括國家工程實驗室、國家地方聯合工程實驗室、科技部和教育部批準設立的新農村發展研究院在內的省級以上（含沈陽市）科學研究機構82個、基礎實驗室及實驗教學中心19個。